彦直讲的“第三事”，竟是要改革当前的官制！而且他要改的还不是细微末节，而是三个最敏感的重症所在：

第一是要改革财权的审计制度，即引入新的统计方法，对全国财政与土地进行一轮新的梳理；

第二是改革司法，要把地方上的政务权与司法权分离开来，在县令之外另设法官，专管一县之法务；

第三条改革内容则是涉及到中央内阁的成员的遴选，原来明朝的内阁制度虽然已行百年之久，却仍是约定俗成形成的官场“潜规则”，内阁大学士在名份上仍然只是皇帝的秘书而已，部分人能够权倾朝野全靠权谋，自蒙古南侵以来，内阁的权力大到无以复加，但也没有明确的成文法确保其地位，李彦直认为天下要想长治久安，就得形成内阁首辅新的、成文的任命制度、任命限期和监督体系，并建议将如何监督大学士也提上议事日程。

这封书信读完后竟渗满了高拱的汗水，其实李彦直所提议的这些变革，在民间——尤其是东南沿海已有相当的现实积累。

比如“科举改革条”，自开海以来，东南的学术便蓬勃发展，对各种新学在开明士子中都十分风行，只是因不列入科举条目，研究这些学问的新秀们不免被老学究们批评为“不务正业”。

又比如财权审计与县级政务法务分立，在大明的新疆土如大员、南洋等地，市舶司总署所在的上海，都已经在实行了。

大明的制度与立法远远赶不上现实的变化，即便如徐阶、高拱等顶级官僚，对这些已经产生的变革也讳莫高深，中央官员对李彦直影响下东南的政务变化、财权变化都是睁一只眼闭一只眼，只是做，不敢说，以免触动整个大明的立国根基。

至于内阁成员的遴选，首辅大臣的去就，更是因循着“规矩”，而不敢明确地提出要将这些官场现状变成明文法实行起来。这两任的首辅徐阶、高拱架空了皇帝，在许多士大夫心中